腘窝囊肿分为原发性与继发性，不同类型病因也有所区别。
1、原发性腘窝囊肿
人体的股四头肌内侧头与半膜肌滑囊以及关节腔间存在一个水平裂隙样结构，长约4-24mm，幼儿期时不明显，随着年龄增加，关节腔内压力异常增高时，关节液会从此裂隙流出，导致滑囊膨大形成囊肿。
2、继发性腘窝囊肿
继发性腘窝囊肿常见于成年患者，大多是因为膝关节损伤、膝关节退行性变、感染性因素等造成的。
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