阴茎结核主要是由于结核分枝杆菌感染、疫苗灌注等原因引起的，环境因素、高危性行为等因素可诱发阴茎结核。
一、基本病因
1、结核分枝杆菌感染
患者的阴茎直接感染或其他部位的结核分枝杆菌转移至其阴茎部位时，结核分枝杆菌可损伤其阴茎组织，引发阴茎结核。
2、疫苗灌注
患者在其膀胱内灌注卡介苗时，药物可流入其阴茎组织内，导致其阴茎出现损伤，无法抵抗结核分枝杆菌的侵犯，从而导致患者发生阴茎结核的情况。
二、诱发因素
1、环境因素
患者长期在结核病高发地区工作或生活时，可导致其患阴茎结核的概率增加。
2、高危性行为
患者与他人发生无保护的性行为时，易造成其阴茎组织直接接触结核分枝杆菌，从而诱发阴茎结核的发生。
