胃脂肪瘤的病因并不明确，炎性刺激、脂肪代谢障碍、胃肠营养不良等原因可能会引发胃脂肪瘤。
1.炎性刺激
患者发生慢性胃炎的情况时，炎症因子可持续对其胃黏膜及黏膜下组织产生刺激，造成其胃间质组织发生病变，从而导致患者发生胃脂肪瘤的情况。
2.脂肪代谢障碍
患者出现脂肪代谢障碍的情况时，未被完全代谢的脂肪组织可在其胃间质堆积，进一步引发胃脂肪瘤的形成。
3.胃肠营养不良
患者发生胃肠营养不良的情况时，可造成其胃肠功能障碍，无法对食物进行消化和吸收，患者此时则会患有胃脂肪瘤。
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