内胚窦瘤的病因不明，可能与生殖细胞迁移错误有关，隐睾可诱发内胚窦瘤的发生。
一、基本病因
生殖细胞迁移错误是引发内胚窦瘤形成的基本病因。患者在发育过程中，出现原始生殖细胞向性腺部位迁移错误的情况时，可造成原始生殖细胞滞留在颅内，不断在其颅内分裂增殖，从而导致患者发生内胚窦瘤的情况。
二、诱发因素
临床研究表明，患者患有隐睾时，其发生内胚窦瘤的可能性相对于其他人体而言要高。
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