咽峡炎可以通过体格检查、血常规、病原学检测等来诊断，具体如下：
1、体格检查
医生首先会观察患者咽部有无充血、疱疹、溃疡等，明确有无扁桃体肿大、扁桃体脓性分泌物、淋巴结肿大等情况，进行初步的判断。
2、血常规
患者可以做血常规检查，如果白细胞、中性粒细胞百分比升高，多提示细菌感染。如果白细胞、中性粒细胞百分比不增高，则可能为病毒感染。
3、病原学检测
通过粪便、咽拭子、疱疹液标本等检测肠道病毒或者是血清特征性抗体浓度，若数值大于正常参考值上限，提示为病毒感染。
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