小阴茎的治疗方法包括心理治疗、药物治疗、手术治疗等。
1、心理治疗
儿童时期、青春期患者会因为阴茎发育不良出现焦虑、自卑等心理，可以通过心理疏导方式进行心理援助。
2、药物治疗
若是因为促性腺激素水平低下造成的阴茎短小，青春期前儿童可以在医生指导下短期内使用绒毛膜促性腺激素治疗，有助于增加睾酮的产生，促进性器官及副性征发育。对于成年男性，可以使用促性腺激素释放激素促进性腺激素与雄激素的产生，重启青春期发育过程，诱导阴茎再次发育;还可通过外源性补充睾酮的方式改善因为睾丸分泌睾酮缺乏引起的小阴茎。
3、手术治疗
青春期后阴茎发育稳定的患者可以通过手术延长，但是需要与患者做好术前沟通，了解患者的期望值。
