胃肠功能紊乱可能与精神心理障碍、饮食因素、胃肠道感染以及其他因素有关。
1、精神心理障碍
精神因素为本病发生的主要病因，比如情绪紧张、焦虑、生活或工作不顺、意外不幸等，均可干扰高级神经的正常活动，进而引起胃肠道功能障碍。
2、饮食因素
据统计，大多数肠易激综合征患者都表现出对某种特定食物不耐受;饮食中的纤维成分较少，也可导致功能性便秘。
3、胃肠道感染
研究表明，有胃肠道感染史的患者，其发生功能性消化不良的风险会明显高于正常人。
4、其他因素
肠易激综合征具有一定的遗传倾向;幽门螺杆菌感染可增加功能性消化不良风险。
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