纤维肌痛综合征病因不明确，可能与遗传因素、自主神经功能障碍、疼痛阈值降低等有关。
1、遗传因素
研究表明纤维肌痛综合征具有一定的遗传基础，如果家族中存在纤维肌痛综合征患者，则其直系亲属发生该病的几率会高于其他人群。
2、自主神经功能障碍
纤维肌痛综合征患者常存在自主神经系统功能异常，所以认为该病的发生与自主神经功能障碍有一定的关系。
3、疼痛阈值降低
纤维肌痛综合征患者疼痛阈值比较低，更容易感受到疼痛。
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