小儿唐氏综合征主要是21号染色体异常引起，导致21号染色体异常的因素则包括遗传因素、母亲高龄、致畸物质等。
1.遗传因素
新生儿父母的生殖细胞在通过减数分裂生成精子或卵子时，21号染色体无法正常分离即可产生异常的精子、卵子，故新生儿也会携带异常染色体并形成小儿唐氏综合征。
2.母亲高龄
孕妇年龄越大，新生儿患小儿唐氏综合征的风险越高，一般孕妇年龄>35岁时发病率明显上升。
3.致畸物质
母体在妊娠期间发生感染、接受放射线照射或接触农药、甲醛、苯等致畸物质都会影响受精卵分裂、增殖，从而导致新生儿形成小儿唐氏综合征。
